OIP106 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-406170

概要

TRAK1はOIP106をコードする遺伝子で、細胞質に存在するアダプターとして、輸送カーゴを微小管上を移動するモーター複合体につなぐことで細胞内輸送の編成に関与すると考えられています。OIP106はミトコンドリアの輸送や細胞内での配置（ポジショニング）と関連づけられており、これらの過程は神経細胞の極性、軸索輸送、ならびに細胞のバイオエネルギーに影響します。こうした役割を通じて、TRAK1はオルガネラ動態、細胞骨格の組織化、ストレス応答といった、細胞の生存や分化を形作る経路の研究対象となっています。オルガネラ輸送やミトコンドリア分布の破綻は、神経発達性疾患や神経変性疾患の機序研究、ならびに細胞エネルギー代謝の異常を伴う他の疾患の研究とも関連があります。

OIP106 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるTRAK1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、TRAK1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、TRAK1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、OIP106タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、OIP106シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、TRAK1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• OIP106の機能に不可欠なTRAK1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、TRAK1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• OIP106 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびOIP106 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、TRAK1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  OIP106 HDRプラスミド（h）および OIP106 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはTRAK1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のTRAK1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。