Nkx-6.3 Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO (h): sc-407505

Visão geral

NKX6-3 codifica o fator de transcrição homeobox Nkx-6.3, um regulador de ligação ao DNA específico de sequência implicado em programas de diferenciação epitelial e na manutenção da identidade regional em tecidos gastrointestinais. Como fator nuclear, o Nkx-6.3 ajuda a moldar redes transcricionais que controlam o comprometimento de linhagem, a proliferação e a maturação, interagindo com vias mais amplas de desenvolvimento e destino celular, incluindo comunicação cruzada com Wnt/β-catenina e outras cascatas de sinalização associadas à diferenciação. Alterações na expressão de NKX6-3 ou na sua atividade regulatória têm sido associadas a perturbações da homeostase mucosa e foram relatadas em estudos de patologia gastrointestinal, sustentando a sua relevância em modelos de disfunção epitelial e de reprogramação transcricional relacionada a doenças.

O Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO Nkx-6.3 (h) é um conjunto de plasmídeos concebido para a interrupção direcionada do gene NKX6-3 em linhas celulares human. Cada plasmídeo coexpressa um RNA guia único (sgRNA) direcionado a um local distinto dentro do NKX6-3, juntamente com a nuclease Cas9 de Streptococcus pyogenes. Os plasmídeos também codificam GFP, permitindo a identificação fluorescente e o enriquecimento de células transfectadas com sucesso por microscopia de fluorescência ou citometria de fluxo.

O design multiguia aumenta a probabilidade de gerar inserções ou deleções (indels) que interrompem o quadro de leitura aberto do NKX6-3 na sequência da formação de quebras de cadeia dupla mediadas por Cas9. As quebras de ADN introduzidas pelo sistema CRISPR/Cas9 são reparadas através de vias endógenas de junção de extremidades não homólogas (NHEJ), resultando frequentemente em mutações de deslocamento de quadro que abolir a expressão da proteína Nkx-6.3.

Este sistema de knockout CRISPR permite a geração eficiente de modelos celulares com deficiência de NKX6-3 para a investigação da sinalização de Nkx-6.3, estudos de genómica funcional, investigação em biologia do cancro e avaliação de respostas terapêuticas em linhas celulares humanas.

Características principais

• sgRNAs direcionados para o(s) exão(ões) NKX6-3 críticos para a função Nkx-6.3
  Coexpressão de SpCas9 e sgRNA a partir de um único plasmídeo para simplificar a administração
  Repórter GFP para identificação de células transfectadas
  Conjunto de plasmídeos direcionados para múltiplos locais genómicos NKX6-3 para melhorar a eficiência do knockout
  Compatível com administração por transfecção

Variantes de Design

CRISPRs +/- HDRs

• Os gRNAs codificados pelo Nkx-6.3 Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO (h) e pelo Nkx-6.3 Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO (h2) têm como alvo locais distintos dentro do locus NKX6-3. Pode estar disponível um ou ambos os designs de alvo. Consulte Produtos Relacionados para verificar a disponibilidade.
  As construções doadoras HDR codificadas pelo Nkx-6.3 Plasmídeo HDR (h) e o Plasmídeo HDR Nkx-6.3 (h2) contêm uma cassete de resistência à puromicina e um repórter RFP flanqueado por braços de homologia NKX6-3 para suportar a reparação dirigida por homologia em locais-alvo NKX6-3 definidos, correspondentes aos desenhos de KO CRISPR/Cas9. A disponibilidade do doador HDR pode variar. Consulte Produtos Relacionados para verificar a disponibilidade.

Apenas para uso em investigação. Não se destina a uso diagnóstico ou terapêutico.