Nkx-6.3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-407505

概要

NKX6-3は、ホメオボックス型転写因子Nkx-6.3をコードしており、配列特異的にDNAへ結合して転写を制御する因子として、上皮の分化プログラムや消化管組織における領域アイデンティティの維持に関与するとされています。核内因子であるNkx-6.3は、系譜決定、増殖、成熟を制御する転写ネットワークの形成に寄与し、Wnt/β-カテニン経路を含む、他の分化関連シグナル伝達カスケードとのクロストークなど、より広範な発生・細胞運命決定経路とも連携します。NKX6-3の発現量や制御活性の変化は、粘膜恒常性の破綻と関連することが示唆されており、消化管病態を扱った研究でも報告されています。これらの知見は、上皮機能障害や疾患に伴う転写リプログラミングのモデルにおいて、NKX6-3が重要であることを支持します。

Nkx-6.3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるNKX6-3遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、NKX6-3内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、NKX6-3のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、Nkx-6.3タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、Nkx-6.3シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、NKX6-3欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• Nkx-6.3の機能に不可欠なNKX6-3エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、NKX6-3ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• Nkx-6.3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびNkx-6.3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、NKX6-3遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  Nkx-6.3 HDRプラスミド（h）および Nkx-6.3 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはNKX6-3ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のNKX6-3標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。