NEIL1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-403778

概要

NEIL1（endonuclease VIII-like 1）はDNAグリコシラーゼ／APリアーゼであり、損傷したピリミジン塩基を含む酸化DNA損傷を認識・切り出すことで塩基除去修復（BER）を開始し、さらにアバシック（脱塩基）部位を処理して鎖切断（切り込み）を促進します。NEIL1は酸化ストレス応答およびゲノム維持経路の中で機能し、下流のBER酵素と協調して、複製や転写の過程でDNAの完全性を回復させます。NEIL1の活性は変異の蓄積や染色体の安定性に影響し、その制御異常は発がんや、酸化DNA損傷に関連する他の疾患の基盤となる機構と結び付けられています。核内の修復因子として、NEIL1は複製関連修復、ミトコンドリア／核ゲノムの安定性、ならびに活性酸素種に対する細胞応答の観点から頻繁に研究されています。

NEIL1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるNEIL1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、NEIL1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、NEIL1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、NEIL1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、NEIL1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、NEIL1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• NEIL1の機能に不可欠なNEIL1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、NEIL1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• NEIL1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびNEIL1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、NEIL1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  NEIL1 HDRプラスミド（h）および NEIL1 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはNEIL1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のNEIL1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。