JMJD5 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-405787

概要

KDM8は、Jumonji Cドメインを含むタンパク質JMJD5をコードしており、JMJD5は核内オキシゲナーゼとして、ヒストンリジンの水酸化／脱メチル化に関連する機構を介してクロマチン制御や転写制御に関与するとされています。JMJD5は、細胞周期の進行、複製ストレス応答、DNA損傷シグナル伝達や代謝適応と交差する遺伝子発現プログラムの調整とも関連づけられています。これらの機能を通じて、JMJD5は増殖関連経路や、がんをはじめクロマチンダイナミクスの破綻を伴う疾患でしばしば変化するエピジェネティック状態に影響を与え得ます。そのためKDM8／JMJD5は、エピジェネティック制御と、状況依存的な転写出力および細胞の適応性（フィットネス）を結び付ける結節点として広く研究されています。

JMJD5 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるKDM8遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、KDM8内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、KDM8のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、JMJD5タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、JMJD5シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、KDM8欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• JMJD5の機能に不可欠なKDM8エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、KDM8ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• JMJD5 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびJMJD5 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、KDM8遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  JMJD5 HDRプラスミド（h）および JMJD5 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはKDM8ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のKDM8標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。