HS3ST3A1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h2): sc-406545-KO-2

概要

HS3ST3A1は、ヘパラン硫酸プロテオグリカンの生合成過程においてグルコサミン残基の3-O-硫酸化を触媒する、ゴルジ体局在性酵素であるヘパラン硫酸-グルコサミン3-O-スルホトランスフェラーゼ3A1をコードします。この修飾はヘパラン硫酸の微細構造の規定に寄与し、その結果、細胞外リガンドの結合や提示のされ方に影響を与えて、細胞表面および細胞外マトリックス内での増殖因子やモルフォゲンのシグナル伝達を形作ります。ヘパラン硫酸の成熟における役割を通じて、HS3ST3A1はFGF、VEGF、ケモカイン介在性シグナル伝達などの経路に影響し得て、下流では細胞接着、遊走、組織リモデリングに作用します。発現の変化やヘパラン硫酸の硫酸化パターンの破綻は、発生過程や、腫瘍進展・炎症性微小環境シグナルなどの疾患関連表現型と関連づけられており、HS3ST3A1依存的なグリコサミノグリカン・リモデリングの機序解明研究が動機づけられています。

HS3ST3A1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）は、human細胞株におけるHS3ST3A1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、HS3ST3A1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、HS3ST3A1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、HS3ST3A1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、HS3ST3A1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、HS3ST3A1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• HS3ST3A1の機能に不可欠なHS3ST3A1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、HS3ST3A1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• HS3ST3A1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびHS3ST3A1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、HS3ST3A1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  HS3ST3A1 HDRプラスミド（h）および HS3ST3A1 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはHS3ST3A1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のHS3ST3A1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。