HoxC5 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-406548

概要

HOXC5は転写因子HoxC5をコードしており、HoxC5はホメオボックス型のDNA結合タンパク質として、胚発生における前後軸パターニングと領域アイデンティティの確立に寄与します。分化した組織では、HoxC5はクロマチン構造や発生シグナル伝達経路と連動する転写ネットワークを制御することで、細胞運命決定、形態形成、移動に関わるプログラムに影響を及ぼし得ます。HOXC5を含むHOX遺伝子の発現パターンの破綻は複数の腫瘍タイプで報告されており、分化状態の変化、浸潤性、転写プログラムの再配線と関連することが多いとされています。発生制御因子としてのHOXC5は、系譜コミットメント、上皮‐間葉系の可塑性、ならびに文脈依存的な遺伝子制御回路の研究においても重要です。

HoxC5 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるHOXC5遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、HOXC5内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、HOXC5のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、HoxC5タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、HoxC5シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、HOXC5欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• HoxC5の機能に不可欠なHOXC5エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、HOXC5ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• HoxC5 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびHoxC5 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、HOXC5遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  HoxC5 HDRプラスミド（h）および HoxC5 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはHOXC5ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のHOXC5標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。