HoxB9 CRISPR Activationプラスミド (h): sc-401770-ACT
- 対象生物種: human
- 20 µg のトランスフェクション準備済み、精製したプラスミドDNA、～20回トランスフェクション
- HoxB9 CRISPR Activationプラスミド (h)は、特異的に遺伝子の発現量を増加させるため、相乗的活性化メディエーター(SAM)転写活性化システムです。
- HoxB9 CRISPR Activationプラスミド (h)は、1:1:1の質量比で以下の3つのプラスミドがら成る：トランス活性化ドメインVP64に溶解する非活性化されたCas9 (dCas9)ヌクレアーゼ(D10A と H840A)をコード化したのプラスミド（ブラストサイジン耐性遺伝子を含めて）、MS2-p65-HSF1融合蛋白質をコード化したのプラスミド（ハイグロマイシン耐性遺伝子を含めて）、2つのMS2 RNAアプタマーに溶解する目標特異的な20ntガイドRNAをコード化したのプラスミド（ピューロマイシン耐性遺伝子を含めて）。
- 得られたSAM複合体は、部位特異的な約200-250nt転写開始点の上流の領域に結合し、転写因子の強いリクルートメントを提供し、遺伝子の高い活性化効果が得られます。
- HoxB9 CRISPR活性化プラスミド（h）およびHoxB9 CRISPR活性化プラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、HOXB9転写開始点の上流にある異なる調節領域を標的としています。いずれか一方、または両方のデザインが利用可能である可能性があります
- トランスフェクションの後、遺伝子ノックアウト効果は、抗体を用いたWB、IFまたはIHCによって検定されることができます: HoxB9 抗体 (H-8): sc-398500
注文情報
| 製品名 | カタログ # | 単位 | 価格 | 数量 | お気に入り | |
HoxB9 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-401770-ACT | 20 µg | $397.00 |
HOXB9は、ホメオボックス型転写因子HoxB9をコードしており、配列特異的にDNAへ結合するタンパク質として、発生過程における前後軸（anterior–posterior）パターニング、組織形態形成、ならびに細胞運命決定を制御します。ヒト細胞では、HOXB9は分化と増殖に影響する転写プログラムに寄与し、HOX補因子との相互作用や、系統特異的エンハンサーをクロマチンを介して制御する仕組みなど、より広範な発生関連の遺伝子制御ネットワークと統合されています。HOXB9の発現異常は、複数のがんの文脈で上皮間葉転換（EMT）様のダイナミクス、血管新生シグナル、浸潤性表現型の変化と関連づけられており、腫瘍性の転写リワイヤリングを研究するうえで有用なノードとなります。核内制御因子としてのHoxB9は、細胞移動、細胞外マトリックス（ECM）リモデリング、幹細胞様状態を司る遺伝子発現回路への影響という観点から、しばしば解析されています。
HoxB9 CRISPR活性化プラスミド（h）は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性HOXB9の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
HoxB9 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における HOXB9 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異（D10AおよびN863A）を有する、触媒活性のないCas9（dCas9）を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はHOXB9転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性HoxB9の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のHOXB9遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるHoxB9依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびHOXB9発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるHoxB9経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。