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hnRNP K CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-417266-ACT | 20 µg | $397.00 |
HNRNPKは、ヘテロ核リボヌクレオタンパク質K(hnRNP K)をコードしており、hnRNP Kは多機能な核酸結合タンパク質です。poly(C)を含むRNA/DNA配列要素や多様なシグナル伝達パートナーとの相互作用を介して、転写、pre-mRNAスプライシング、mRNA安定性、翻訳を協調的に制御します。hnRNP KはMAPK/ERK経路やDNA損傷応答ネットワークなどからのシグナルを統合し、クロマチン関連の遺伝子発現プログラムやストレス適応的なRNAプロセシングを調節します。リボヌクレオタンパク質複合体の足場として機能することで、細胞周期の進行、アポトーシス、分化に影響を及ぼします。HNRNPKの発現または機能の破綻は、がん化や神経発生に関わる遺伝子制御の異常と関連することが報告されており、RNA生物学の機構解析やシグナル依存的な転写制御の研究において有用な結節点(ノード)となります。
hnRNP K CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性HNRNPKの発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
hnRNP K CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における HNRNPK 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はHNRNPK転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性hnRNP Kの発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のHNRNPK遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるhnRNP K依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびHNRNPK発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるhnRNP K経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。