DDX23 Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO (h): sc-407132

Visão geral

DDX23 codifica uma helicase de RNA da família DEAD-box que atua como um componente central do snRNP U5 no spliceossomo, onde ajuda a remodelar complexos de RNA–proteína para sustentar o splicing do pré‑mRNA. Ao regular o reconhecimento de sítios de splicing e a dinâmica do spliceossomo, a DDX23 influencia a maturação de transcritos, o equilíbrio de isoformas e programas de expressão gênica a jusante ligados à progressão do ciclo celular e às respostas ao estresse. A perturbação de helicases associadas ao spliceossomo pode alterar padrões de splicing alternativo e a fidelidade do processamento de RNA, processos frequentemente implicados na reprogramação transcricional oncogênica e na instabilidade genômica. Como resultado, a DDX23 é comumente estudada no contexto do metabolismo de RNA, da proteostase e de vias que acoplam o splicing à sinalização de danos ao DNA.

O Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO DDX23 (h) é um conjunto de plasmídeos concebido para a interrupção direcionada do gene DDX23 em linhas celulares human. Cada plasmídeo coexpressa um RNA guia único (sgRNA) direcionado a um local distinto dentro do DDX23, juntamente com a nuclease Cas9 de Streptococcus pyogenes. Os plasmídeos também codificam GFP, permitindo a identificação fluorescente e o enriquecimento de células transfectadas com sucesso por microscopia de fluorescência ou citometria de fluxo.

O design multiguia aumenta a probabilidade de gerar inserções ou deleções (indels) que interrompem o quadro de leitura aberto do DDX23 na sequência da formação de quebras de cadeia dupla mediadas por Cas9. As quebras de ADN introduzidas pelo sistema CRISPR/Cas9 são reparadas através de vias endógenas de junção de extremidades não homólogas (NHEJ), resultando frequentemente em mutações de deslocamento de quadro que abolir a expressão da proteína DDX23.

Este sistema de knockout CRISPR permite a geração eficiente de modelos celulares com deficiência de DDX23 para a investigação da sinalização de DDX23, estudos de genómica funcional, investigação em biologia do cancro e avaliação de respostas terapêuticas em linhas celulares humanas.

Características principais

• sgRNAs direcionados para o(s) exão(ões) DDX23 críticos para a função DDX23
  Coexpressão de SpCas9 e sgRNA a partir de um único plasmídeo para simplificar a administração
  Repórter GFP para identificação de células transfectadas
  Conjunto de plasmídeos direcionados para múltiplos locais genómicos DDX23 para melhorar a eficiência do knockout
  Compatível com administração por transfecção

Variantes de Design

CRISPRs +/- HDRs

• Os gRNAs codificados pelo DDX23 Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO (h) e pelo DDX23 Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO (h2) têm como alvo locais distintos dentro do locus DDX23. Pode estar disponível um ou ambos os designs de alvo. Consulte Produtos Relacionados para verificar a disponibilidade.
  As construções doadoras HDR codificadas pelo DDX23 Plasmídeo HDR (h) e o Plasmídeo HDR DDX23 (h2) contêm uma cassete de resistência à puromicina e um repórter RFP flanqueado por braços de homologia DDX23 para suportar a reparação dirigida por homologia em locais-alvo DDX23 definidos, correspondentes aos desenhos de KO CRISPR/Cas9. A disponibilidade do doador HDR pode variar. Consulte Produtos Relacionados para verificar a disponibilidade.

Apenas para uso em investigação. Não se destina a uso diagnóstico ou terapêutico.