COL23A1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-413896

Übersicht

COL23A1 kodiert Kollagen Typ XXIII Alpha 1, ein transmembranöses Kollagen, das an der Zelloberfläche angereichert ist und dort zur Organisation der extrazellulären Matrix (ECM) sowie zur Zell–Matrix-Adhäsion beiträgt. Durch die Beeinflussung von Interaktionen mit Komponenten der Basalmembran und integrinassoziierten Komplexen kann COL23A1 Prozesse modulieren, die mit epithelialer Architektur, Migration und Gewebeumbau verknüpft sind. Eine veränderte COL23A1-Expression wurde in mehreren krebs- und fibrosebezogenen Kontexten beschrieben, was seine Eignung als Marker und mechanistischer Knotenpunkt in Studien zu Invasion, metastatischem Potenzial und stromalem Remodeling unterstreicht. Als membranassoziiertes Kollagen bietet es einen gut zugänglichen Ansatzpunkt, um zu untersuchen, wie perizelluläre ECM-Signale die Signalübertragung und das Zellverhalten prägen.

Das COL23A1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des COL23A1-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des COL23A1-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von COL23A1 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die COL23A1-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von COL23A1-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der COL23A1-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf COL23A1-Exone abzielen, die für die COL23A1-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere COL23A1-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom COL23A1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom COL23A1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des COL23A1-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das COL23A1 HDR-Plasmid (h) und COL23A1 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von COL23A1-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten COL23A1-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.