CAB39L CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-416543

概要

CAB39Lはカルシウム結合タンパク質39様（calcium-binding protein 39-like）をコードし、セリン/スレオニンキナーゼであるSTK11/LKB1と会合してLKB1–STRAD–CAB39からなる足場（スキャフォールド）複合体の形成と機能を促進する、保存性の高いアダプタータンパク質です。この複合体を介してCAB39LはAMPKファミリーキナーゼの活性化を支え、細胞のエネルギー状態を代謝制御、ストレス応答、ならびに極性プログラムへと結び付けます。CAB39L依存的なシグナル伝達は、AMPK関連経路を通じてミトコンドリア恒常性、オートファジー制御、上皮組織化などの過程に影響します。LKB1–AMPK軸の構成要素の破綻はがん生物学や代謝疾患の機序に関与するとされており、CAB39Lは経路の配線や状況依存的な脆弱性を解析するうえで有用な結節点となります。

CAB39L CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるCAB39L遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、CAB39L内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、CAB39Lのオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、CAB39Lタンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、CAB39Lシグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、CAB39L欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• CAB39Lの機能に不可欠なCAB39Lエクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、CAB39Lゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• CAB39L CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびCAB39L CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、CAB39L遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  CAB39L HDRプラスミド（h）および CAB39L HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはCAB39Lホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のCAB39L標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。