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BR-cadherin CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-401987-ACT | 20 µg | $397.00 |
CDH12は、神経系に多く発現する古典的カドヘリンであるBR-カドヘリンをコードしており、Ca2+依存的な同種間(ホモフィリック)の細胞—細胞接着を仲介して組織構築を支えます。BR-カドヘリンはカテニン結合とアクチン細胞骨格への連結を介して、接着結合(アドヘレンスジャンクション)の構築、細胞極性、ならびに神経発生を形作る協調的な細胞移動プログラムに関与します。カドヘリンの発現異常は、上皮/神経細胞における接着ダイナミクスを乱し、Wnt/β-カテニン経路やRho GTPaseにより制御される細胞骨格リモデリングなどの経路とのシグナルクロストークにも影響し得ます。CDH12の発現制御異常は、神経発達表現型や腫瘍生物学に関する研究で報告されており、接着状態の変化が浸潤、神経回路の結合性、分化にどのような影響を与えるのかを検討する動機となっています。
BR-cadherin CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性CDH12の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
BR-cadherin CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における CDH12 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はCDH12転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性BR-cadherinの発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のCDH12遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるBR-cadherin依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびCDH12発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるBR-cadherin経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。