BAT1 Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO (h): sc-403785

Visão geral

DDX39B codifica a BAT1 (também conhecida como UAP56), uma helicase de RNA conservada do tipo DEAD-box que promove a remodelação, dependente de ATP, de complexos RNA–proteína durante o splicing do pré‑mRNA e a exportação de mRNA. A BAT1 atua em conjunto com a maquinaria TREX/de exportação para acoplar a transcrição, a dinâmica do spliceossoma e a exportação nuclear, moldando assim programas de expressão génica e o controlo de qualidade do RNA. Por meio destas funções, a atividade de DDX39B influencia a proliferação celular, respostas ao stress e a sinalização imunitária inata associada ao processamento de RNA. A regulação alterada de helicases de RNA e a biogénese de mRNPs é frequentemente associada a estados transcricionais oncogénicos e fenótipos inflamatórios, tornando a BAT1 um alvo útil para estudos mecanísticos do metabolismo de RNA em modelos relevantes para doenças.

O Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO BAT1 (h) é um conjunto de plasmídeos concebido para a interrupção direcionada do gene DDX39B em linhas celulares human. Cada plasmídeo coexpressa um RNA guia único (sgRNA) direcionado a um local distinto dentro do DDX39B, juntamente com a nuclease Cas9 de Streptococcus pyogenes. Os plasmídeos também codificam GFP, permitindo a identificação fluorescente e o enriquecimento de células transfectadas com sucesso por microscopia de fluorescência ou citometria de fluxo.

O design multiguia aumenta a probabilidade de gerar inserções ou deleções (indels) que interrompem o quadro de leitura aberto do DDX39B na sequência da formação de quebras de cadeia dupla mediadas por Cas9. As quebras de ADN introduzidas pelo sistema CRISPR/Cas9 são reparadas através de vias endógenas de junção de extremidades não homólogas (NHEJ), resultando frequentemente em mutações de deslocamento de quadro que abolir a expressão da proteína BAT1.

Este sistema de knockout CRISPR permite a geração eficiente de modelos celulares com deficiência de DDX39B para a investigação da sinalização de BAT1, estudos de genómica funcional, investigação em biologia do cancro e avaliação de respostas terapêuticas em linhas celulares humanas.

Características principais

• sgRNAs direcionados para o(s) exão(ões) DDX39B críticos para a função BAT1
  Coexpressão de SpCas9 e sgRNA a partir de um único plasmídeo para simplificar a administração
  Repórter GFP para identificação de células transfectadas
  Conjunto de plasmídeos direcionados para múltiplos locais genómicos DDX39B para melhorar a eficiência do knockout
  Compatível com administração por transfecção

Variantes de Design

CRISPRs +/- HDRs

• Os gRNAs codificados pelo BAT1 Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO (h) e pelo BAT1 Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO (h2) têm como alvo locais distintos dentro do locus DDX39B. Pode estar disponível um ou ambos os designs de alvo. Consulte Produtos Relacionados para verificar a disponibilidade.
  As construções doadoras HDR codificadas pelo BAT1 Plasmídeo HDR (h) e o Plasmídeo HDR BAT1 (h2) contêm uma cassete de resistência à puromicina e um repórter RFP flanqueado por braços de homologia DDX39B para suportar a reparação dirigida por homologia em locais-alvo DDX39B definidos, correspondentes aos desenhos de KO CRISPR/Cas9. A disponibilidade do doador HDR pode variar. Consulte Produtos Relacionados para verificar a disponibilidade.

Apenas para uso em investigação. Não se destina a uso diagnóstico ou terapêutico.