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Atg16CRISPR激活质粒(m) | sc-429488-ACT | 20 µg | $397.00 | |||
Atg16CRISPR激活质粒(m2) | sc-429488-ACT-2 | 20 µg | $397.00 |
小鼠 Atg16l1 编码 Atg16 蛋白,它是 ATG12–ATG5–ATG16L1 复合体的核心组成部分。该复合体通过促进 LC3 脂质化以及隔离膜(phagophore)扩张来协调自噬体的生物发生。该蛋白将上游的营养与应激信号与选择性自噬和非选择性(总体)自噬连接起来,从而影响线粒体质量控制、抗微生物反应以及炎症信号输出。ATG16L1 功能改变与肠道屏障生物学和先天免疫调控相关,因此与宿主–微生物互作、炎症表型及细胞内在应激适应等研究密切相关。在实验系统中,扰动 Atg16l1 可调节自噬通量及其下游细胞因子通路,有助于对依赖自噬的稳态机制进行解析。
Atg16 CRISPR激活质粒(m)提供了一种靶向、非破坏性的方法,可在不改变底层DNA序列的情况下上调内源性Atg16l1的表达。
Atg16 CRISPR激活质粒(m)是一个由三条质粒组成的协同激活介导(SAM)系统,旨在对人类细胞系中的Atg16l1基因座进行高效、位点特异性的转录上调。该系统以一种携带两个失活突变(D10A 和 N863A)的无催化活性的 Cas9(dCas9)为核心,这些突变消除了核酸酶活性,同时保留了 DNA 结合能力。该 dCas9 与强效转录激活因子 VP64 融合,并与用于筛选的布拉西定抗性基因共同表达。第二个质粒编码MS2-p65-HSF1融合蛋白——这一二级激活复合物与dCas9-VP64协同作用,并携带潮霉素抗性基因。第三个质粒编码靶标特异性20 nt sgRNA,其与两个MS2 RNA适配体融合,这些适配体可将MS2-p65-HSF1复合物招募至激活位点,并携带嘌呤霉素抗性基因。这三个质粒按1:1:1的质量比递送,以确保系统所有组分的平衡表达。
在靶位点组装完成后,SAM复合物结合于Atg16l1转录起始位点上游约200 bp处,VP64、p65和HSF1在此协同作用,招募转录 machinery并驱动内源性Atg16表达上调。与具有核酸酶活性的Cas9不同, dCas9不会引入双链断裂或修改基因组序列,从而保留了原生的Atg16l1位点,并能够研究内源性位点上依赖于Atg16的转录反应,使其成为功能研究、靶基因鉴定以及在Atg16l1表达被沉默或降低的肿瘤细胞中模拟Atg16通路恢复的宝贵工具。
仅供研究使用。不用于诊断或治疗。