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ALKBH2 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-407363-ACT | 20 µg | $397.00 |
ALKBH2(AlkB homolog 2)は、Fe(II)/2-オキソグルタル酸依存性ジオキシゲナーゼであり、1-メチルアデニンや3-メチルシトシンなどの損傷を直接元に戻すことで、DNAのアルキル化損傷を修復します。正常な塩基対形成を回復することにより、ALKBH2はDNA複製時のゲノム安定性を維持し、塩基除去修復(BER)や、より広範なDNA損傷応答(DDR)経路と連携します。その活性は、内因性および環境由来のアルキル化剤に対する細胞応答に関与しており、ALKBH2の発現は変異負荷や複製ストレスと関連づけられます。ALKBH2の制御異常は、腫瘍生物学や治療に伴うDNA損傷耐性といった文脈で研究されており、修復能の変化がゲノム完全性の表現型に影響し得ます。
ALKBH2 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性ALKBH2の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
ALKBH2 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における ALKBH2 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はALKBH2転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性ALKBH2の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のALKBH2遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるALKBH2依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびALKBH2発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるALKBH2経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。