Gli inibitori chimici di SerpinA1e possono esercitare i loro effetti inibitori attraverso vari meccanismi, tutti convergenti sulla riduzione dell'attività proteasica della proteina. La benzamidina, un noto inibitore della serina proteasi, si lega direttamente al sito attivo della SerpinA1e, determinando l'inibizione della sua attività. Analogamente, il fenilmetilsulfonilfluoruro (PMSF) inibisce irreversibilmente le serina-proteasi modificando il residuo di serina nel sito attivo di SerpinA1e, bloccandone così la funzione enzimatica. L'aprotinina, un altro inibitore, forma complessi stabili con le serina-proteasi, compresa la SerpinA1e, inibendo efficacemente la loro attività proteolitica attraverso l'ostacolo sterico, impedendo alle molecole di substrato di accedere al sito attivo.
Antipain inibisce le serine proteasi legandosi in modo competitivo ai loro siti attivi, un meccanismo che riduce direttamente la funzione proteolitica di SerpinA1e. Anche la leupeptina e la chimostatina si legano reversibilmente e fortemente, rispettivamente, al sito attivo delle serin-proteasi, inibendo così l'attività di SerpinA1e. L'AEBSF, un altro inibitore irreversibile, si lega covalentemente al residuo di serina della SerpinA1e, portando all'inattivazione della sua attività proteasica. Gabexato mesilato e Camostat mesilato inibiscono la proteina impedendo l'accesso del substrato al suo sito attivo, inibendo così l'attività di SerpinA1e. L'Nα-Tosil-L-lisina clorometilchetone (TLCK) e l'Nα-Tosil-L-fenilalanina clorometilchetone (TPCK) agiscono modificando i residui aminoacidici chiave nel sito attivo della SerpinA1e, in particolare i residui di serina e istidina, culminando nell'inattivazione della sua funzione proteasica. Infine, Nafamostat mesilato si lega al sito attivo di SerpinA1e, ostacolando l'ingresso del substrato e impedendo la scissione proteolitica, essenziale per l'attività di SerpinA1e. Ciascuna di queste sostanze chimiche ha come bersaglio il sito attivo o i residui cruciali di SerpinA1e necessari per la sua attività di proteasi, determinando un'inibizione funzionale della proteina.
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