POLR2D Inibitori

I comuni inibitori di POLR2D includono, ma non sono limitati a, l'α-Amanitina CAS 23109-05-9, il Triptolide CAS 38748-32-2, il DRB CAS 53-85-0, l'Actinomicina D CAS 50-76-0 e la Cordycepina CAS 73-03-0.

Gli inibitori chimici della subunità POLR2D della RNA polimerasi II (Pol II) utilizzano diversi meccanismi per ostacolare il processo di trascrizione. L'α-Amanitina, ad esempio, colpisce direttamente la Pol II legandosi ad essa e impedendo all'enzima di trascrivere il DNA in RNA messaggero (mRNA). Questo legame è altamente specifico e determina una forte inibizione dell'attività dell'enzima.. L'azione dell'α-Amanitina mostra un effetto profondo sulla funzione della subunità POLR2D, in quanto POLR2D è parte integrante del complesso Pol II. Il triptolide, invece, interferisce con il macchinario di trascrizione legandosi covalentemente alla subunità XPB del complesso del fattore di trascrizione IIH (TFIIH), fondamentale per l'iniziazione della trascrizione. Questo legame interrompe l'assemblaggio e la stabilità del complesso di iniziazione, inibendo così l'attività trascrizionale di Pol II.

Altri composti, come DRB, Actinomicina D e Cordycepin, dimostrano ulteriori meccanismi d'azione unici. DRB agisce bloccando la fosforilazione del dominio C-terminale (CTD) della subunità maggiore di Pol II, essenziale per l'allungamento dei trascritti. Questo agisce su POLR2D arrestando la progressione della polimerasi lungo il DNA. L'actinomicina D esercita il suo effetto inibitorio intercalando il DNA nel complesso di iniziazione della trascrizione, impedendo così la fase di allungamento della trascrizione da parte della RNA polimerasi II. La cordycepina, un analogo del nucleoside, termina l'allungamento della catena di mRNA incorporandosi nella catena di RNA in crescita. Questo porta a un arresto prematuro del processo di trascrizione, influenzando indirettamente il ruolo di POLR2D. Infine, la tagetitossina si lega e stabilizza il complesso di iniziazione della trascrizione, impedendo la transizione alla fase di allungamento, essenziale per l'attività di POLR2D nel processo di trascrizione. Ciascuno di questi inibitori, attraverso interazioni distinte con la subunità POLR2D o con i complessi associati, ostacola efficacemente il processo complessivo di trascrizione condotto dalla RNA polimerasi II.