La denominazione di attivatori LOC345630 si riferisce a una classe di composti chimici che interagiscono con il locus genetico denominato LOC345630. Nel lessico genomico, il prefisso LOC è comunemente usato per indicare loci per i quali il prodotto genico associato non è ben caratterizzato, spesso perché rappresenta un gene previsto dall'analisi computazionale piuttosto che uno confermato empiricamente. Il codice numerico 345630 funge da identificatore unico per questo particolare locus. Gli attivatori che mirano a questo locus sono probabilmente progettati per potenziare l'attività della proteina o della sequenza di RNA trascritta da questa parte del genoma. La natura di questi attivatori dipenderebbe dalla funzione biologica del prodotto LOC345630; se si tratta di una proteina, gli attivatori potrebbero agire stabilizzando la forma attiva della proteina, aumentandone l'espressione o facilitando un'interazione più efficiente con i suoi substrati naturali o partner di legame all'interno della cellula.
Per esplorare il concetto di attivatori di LOC345630, i ricercatori dovrebbero prima intraprendere un'indagine dettagliata sul carattere e sulla funzione di LOC345630. Se il locus codifica una proteina, gli studi iniziali si concentrerebbero sulla delucidazione della sua sequenza aminoacidica, della sua struttura e del suo ruolo all'interno della cellula. Tecniche come il clonaggio genico e l'analisi dell'espressione, insieme a metodi di purificazione e caratterizzazione della proteina, fornirebbero informazioni sui dettagli molecolari del prodotto genico. Se la struttura della proteina potesse essere determinata attraverso metodi come la cristallografia a raggi X o la spettroscopia di risonanza magnetica nucleare (NMR), si potrebbero identificare i potenziali siti di legame dell'attivatore. Questi siti sarebbero il bersaglio per la progettazione di piccole molecole o altri tipi di composti in grado di legarsi alla proteina e modulare la sua attività. Il passo successivo sarebbe lo screening di librerie chimiche alla ricerca di molecole che si legano a questi siti e aumentano l'attività della proteina LOC345630. I risultati di questi screening verrebbero poi ottimizzati attraverso sforzi di chimica medicinale, migliorando la loro specificità per il bersaglio e la loro capacità di modulare la sua attività. Queste iterazioni comporterebbero una combinazione di chimica sintetica, modellazione computazionale per prevedere e migliorare le interazioni ligando-proteina e test biologici per confermare l'attività dei composti. L'obiettivo finale di questo processo sarebbe quello di sviluppare una collezione di composti in grado di agire come attivatori di LOC345630, definiti dalla loro capacità di aumentare la funzione del prodotto genico codificato da LOC345630.
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Nome del prodotto | CAS # | Codice del prodotto | Quantità | Prezzo | CITAZIONI | Valutazione |
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Retinoic Acid, all trans | 302-79-4 | sc-200898 sc-200898A sc-200898B sc-200898C | 500 mg 5 g 10 g 100 g | $65.00 $319.00 $575.00 $998.00 | 28 | |
L'acido retinoico può modulare l'espressione genica e può influenzare l'espressione di proteine nucleari come la "fibrillarina simile 1". | ||||||
Sodium Butyrate | 156-54-7 | sc-202341 sc-202341B sc-202341A sc-202341C | 250 mg 5 g 25 g 500 g | $30.00 $46.00 $82.00 $218.00 | 18 | |
Come inibitore dell'istone deacetilasi, può alterare la struttura della cromatina e potenziare la trascrizione di alcuni geni, compresi quelli che codificano per le proteine nucleari. | ||||||
Actinomycin D | 50-76-0 | sc-200906 sc-200906A sc-200906B sc-200906C sc-200906D | 5 mg 25 mg 100 mg 1 g 10 g | $73.00 $238.00 $717.00 $2522.00 $21420.00 | 53 | |
Questo antibiotico si lega al DNA e può influenzare ampiamente la trascrizione, alterando potenzialmente l'espressione delle proteine nucleari. | ||||||
5-Azacytidine | 320-67-2 | sc-221003 | 500 mg | $280.00 | 4 | |
Un farmaco che inibisce le metiltransferasi del DNA potrebbe portare alla derepressione dei geni, compresi quelli che codificano per le proteine nucleari. | ||||||
Chloroquine | 54-05-7 | sc-507304 | 250 mg | $68.00 | 2 | |
Conosciuta per intercalare il DNA e alterare l'espressione genica, potrebbe avere un impatto sull'espressione di proteine come la "fibrillarina simile 1". | ||||||
Trichostatin A | 58880-19-6 | sc-3511 sc-3511A sc-3511B sc-3511C sc-3511D | 1 mg 5 mg 10 mg 25 mg 50 mg | $149.00 $470.00 $620.00 $1199.00 $2090.00 | 33 | |
Questo inibitore dell'istone deacetilasi potrebbe influire sulla struttura della cromatina e sull'espressione genica, influenzando potenzialmente i livelli di proteine nucleari. | ||||||
Hydrogen Peroxide | 7722-84-1 | sc-203336 sc-203336A sc-203336B | 100 ml 500 ml 3.8 L | $30.00 $60.00 $93.00 | 27 | |
Lo stress ossidativo può portare a risposte cellulari che includono l'upregulation delle proteine nucleolari coinvolte nella biogenesi dei ribosomi. | ||||||
Homoharringtonine | 26833-87-4 | sc-202652 sc-202652A sc-202652B | 1 mg 5 mg 10 mg | $51.00 $123.00 $178.00 | 11 | |
È noto che inibisce la sintesi proteica, il che potrebbe innescare un aumento compensativo delle proteine della biogenesi dei ribosomi. | ||||||
Mycophenolic acid | 24280-93-1 | sc-200110 sc-200110A | 100 mg 500 mg | $68.00 $261.00 | 8 | |
Come inibitore dell'inosina monofosfato deidrogenasi, può portare a risposte di stress cellulare che interessano le proteine nucleolari. | ||||||
Leptomycin B | 87081-35-4 | sc-358688 sc-358688A sc-358688B | 50 µg 500 µg 2.5 mg | $105.00 $408.00 $1224.00 | 35 | |
Inibisce l'esportazione nucleare e può portare all'accumulo di proteine nucleari a causa dell'alterazione del traffico nucleocitoplasmatico. |