Tra i composti inibitori di HEATR6 che agiscono sulla dinamica dei microtubuli spiccano Paclitaxel, Nocodazolo, Monastrol, Griseofulvina e Colchicina. Queste sostanze hanno come bersaglio la polimerizzazione e la depolimerizzazione della tubulina, un componente chiave dei microtubuli, interrompendo così potenzialmente le attività legate a HEATR6 se quest'ultimo è coinvolto nel trasporto cellulare o nella mitosi. Gli inibitori della chinasi di questa classe, come Alsterpaullone, Roscovitina, BI 2536 e MLN8237 (Alisertib), esercitano i loro effetti modulando i checkpoint del ciclo cellulare e l'assemblaggio del fuso mitotico. Questa modulazione può avere un impatto su HEATR6 se ha un ruolo nella dinamica cromosomica o nella divisione cellulare.
La brefeldina A, un inibitore del traffico di vescicole tra il reticolo endoplasmatico e l'apparato di Golgi, potrebbe influenzare la localizzazione e la funzione di HEATR6 alterandone il traffico intracellulare. La wortmannina, un inibitore della fosfoinositide 3-chinasi, influisce sulle vie di segnalazione che, se correlate a HEATR6, possono modulare il suo ruolo cellulare. ZM447439, simile ad Alisertib, ha come bersaglio le Aurora chinasi e può interrompere eventi mitotici come l'allineamento e la segregazione dei cromosomi, processi in cui HEATR6 potrebbe essere implicato.
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