Gli inibitori chimici di FANK1 possono ottenere un'inibizione funzionale attraverso vari meccanismi, prendendo di mira le vie di segnalazione di cui FANK1 fa notoriamente parte. La staurosporina, un inibitore della protein-chinasi ad ampio spettro, può ostacolare l'attività chinasica di FANK1 impedendo la fosforilazione dei suoi substrati, che è un passaggio cruciale per la sua funzione. Analogamente, la 5-Iodotubercidina, in quanto inibitore dell'adenosina chinasi, può bloccare la fosforilazione dell'adenosina, interrompendo potenzialmente FANK1. LY294002 e Wortmannin, entrambi inibitori della PI3K, possono sopprimere la via di segnalazione PI3K/Akt. PD98059 e U0126, che hanno come bersaglio MEK all'interno della via delle MAP chinasi, possono impedire l'attivazione di FANK1.
Inoltre, SP600125 agisce come inibitore di JNK e può inibire funzionalmente FANK1. Anche SB203580, inibendo la p38 MAP chinasi, può interferire con l'attività di FANK1. La rapamicina, un inibitore di mTOR, può sopprimere la funzione di FANK1. PP2, che inibisce le chinasi della famiglia Src, potrebbe interrompere la segnalazione della chinasi Src, influenzando di conseguenza l'attività di FANK1. Infine, il gefitinib, che inibisce specificamente la tirosin-chinasi EGFR, ostacolerebbe l'attività di FANK1.
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