Gli inibitori di CCDC63 comprendono una vasta gamma di composti che possono influenzare indirettamente la sua attività funzionale attraverso i loro effetti su vari processi cellulari e vie di segnalazione. Ad esempio, la brefeldina A e la monensina sono note per alterare la funzione e il mantenimento dell'apparato di Golgi, il che potrebbe portare a un'errata localizzazione o a un'impropria modificazione post-traslazionale di CCDC63, compromettendone così la funzione. Allo stesso modo, agenti mirati ai microtubuli come il paclitaxel e il nocodazolo, noti per arrestare la progressione del ciclo cellulare, potrebbero inibire indirettamente la funzione di CCDC63 se questa dipende da spunti del ciclo cellulare o dalla dinamica dei microtubuli.
Inoltre, le azioni degli inibitori CDK come il Purvalanolo A, che impediscono la progressione del ciclo cellulare, possono portare indirettamente all'inibizione di CCDC63 se la sua attività è regolata attraverso vie di segnalazione dipendenti dal ciclo cellulare. Gli inibitori di chinasi mitotiche chiave, come MLN8237, ZM447439 e BI 2536, dimostrano il potenziale di inibire CCDC63 interrompendo processi come l'allineamento dei cromosomi, l'assemblaggio del fuso e l'uscita dalla mitosi, che potrebbero essere essenziali per la corretta funzione di CCDC63.
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