Gli inibitori della CCDC43, come la cicloeximide e la rapamicina, sono noti per ridurre la sintesi proteica complessiva, il che potrebbe comportare una diminuzione dei livelli della proteina CCDC43. Inibitori come la brefeldina A, la monensina e il nocodazolo interrompono le vie di trasporto intracellulare, influenzando potenzialmente il traffico e la localizzazione di CCDC43 all'interno della cellula.
Altre molecole, tra cui MG132 e clorochina, possono influenzare la stabilità della proteina e le vie di degradazione, alterando il tasso di turnover di CCDC43. Agenti come U18666A e mevastatina alterano il metabolismo e il trasporto del colesterolo, influenzando potenzialmente i compartimenti cellulari e i microdomini di membrana in cui CCDC43 potrebbe trovarsi o essere necessario per una corretta funzione. Inoltre, composti come il 2-deossi-D-glucosio e la tunicamicina interferiscono con processi fondamentali come la glicolisi e la glicosilazione delle proteine, rispettivamente. Se il CCDC43 dipende dalla glicosilazione per la sua stabilità o attività, la tunicamicina potrebbe avere un impatto sulla sua funzione. Inoltre, la tapsigargina, influenzando l'omeostasi del calcio, potrebbe influenzare le vie di segnalazione o gli eventi cellulari che coinvolgono CCDC43.
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