Inibitori come la staurosporina e l'U0126 funzionano ostacolando l'attività delle chinasi, che sono fondamentali per la fosforilazione e l'attivazione di molte proteine coinvolte nelle vie di segnalazione. Composti come LY294002 e wortmannin hanno come bersaglio specifiche chinasi all'interno della via PI3K/AKT/mTOR, un condotto centrale per i segnali che regolano la crescita, la proliferazione e la sopravvivenza delle cellule. Questi inibitori possono modulare l'attività di proteine regolate da eventi di fosforilazione e de-fosforilazione.
Allo stesso modo, la rapamicina e i suoi analoghi inibiscono la via mTOR, che è profondamente integrata con la sintesi proteica e l'autofagia, influenzando un'ampia gamma di funzioni cellulari. La brefeldina A e la cicloeximide, invece, interrompono processi cellulari fondamentali come il trasporto e la sintesi delle proteine, rispettivamente, con un impatto sulla funzione proteica su vasta scala. Composti come il 2-Deossi-D-glucosio interferiscono con le vie di produzione di energia come la glicolisi, il che potrebbe avere un impatto sulle proteine che richiedono ATP per la loro attività. L'MG132 inibisce il sistema ubiquitina-proteasoma, portando all'accumulo di proteine solitamente destinate alla degradazione, con potenziali effetti sul turnover e sulla funzione delle proteine.
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