Gli inibitori BAF comprendono una serie di composti che, direttamente o indirettamente, modulano l'attività del complesso BAF, un attore chiave nel rimodellamento della cromatina e nella regolazione dell'espressione genica. Questa classe di inibitori comprende principalmente composti che hanno come bersaglio le principali vie di segnalazione e i processi enzimatici strettamente legati alla modificazione della cromatina e alla regolazione genica. La prima categoria di inibitori BAF comprende quelli che hanno come bersaglio le modificazioni istoniche direttamente associate alla struttura e all'accessibilità della cromatina. Composti come la tricostatina A, il Vorinostat e il Panobinostat esemplificano questa categoria. Questi inibitori, avendo come bersaglio le HDAC, alterano lo stato di acetilazione degli istoni, il che può avere un impatto indiretto sull'attività del complesso BAF, modificando l'accessibilità della cromatina e la dinamica del rimodellamento cromatinico. Questa alterazione della struttura della cromatina è cruciale nella regolazione dell'espressione genica, dove il complesso BAF svolge un ruolo significativo.
La seconda categoria comprende gli inibitori che agiscono sulla metilazione del DNA o sui processi di riconoscimento degli istoni, che possono influenzare indirettamente l'attività del BAF a causa della natura interconnessa dei meccanismi di modificazione della cromatina. La 5-azacitidina e la decitabina, in quanto inibitori della DNMT, rientrano in questa categoria. Agendo sui modelli di metilazione del DNA, questi composti possono modulare indirettamente il rimodellamento della cromatina e la regolazione genica mediata dal complesso BAF. Analogamente, JQ1 e I-BET762, inibendo le proteine bromodominio BET, alterano la lettura degli istoni acetilati, influenzando il ruolo del complesso BAF nella dinamica della cromatina. Questi inibitori funzionano alterando l'ambiente cellulare in cui opera il complesso BAF, influenzando così il suo ruolo nel rimodellamento della cromatina e nella regolazione dell'espressione genica. I meccanismi d'azione di questi composti, pur non avendo come bersaglio diretto il complesso BAF, possono portare a cambiamenti nell'attività del complesso o nel suo stato funzionale, influenzando in ultima analisi il suo ruolo nella regolazione genica. Questo approccio indiretto all'inibizione del complesso BAF mette in evidenza la complessa rete di meccanismi di modificazione della cromatina che regolano l'espressione genica e la capacità di colpire questi meccanismi per modulare l'attività di complessi chiave come il BAF.
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