Allophycocyanin Inibitori

Gli inibitori comuni dell'alloficocianina includono, a titolo esemplificativo, il solfato di rame (II) CAS 7758-98-7, la clorpromazina CAS 50-53-3, la N-etilmaleimide CAS 128-53-0, il cloridrato di guanidina CAS 50-01-1 e l'urea CAS 57-13-6.

Gli inibitori dell'alloficina sono una serie di sostanze chimiche che modulano la struttura e la funzione della proteina in vari modi. Possono essere classificati in base alla loro modalità d'azione. Sostanze chimiche come il solfato di rame e il solfato di zinco si legano direttamente alla proteina, influenzandone la struttura terziaria e compromettendo così la sua capacità di catturare efficacemente l'energia luminosa. Un'altra serie di sostanze chimiche, come la clorpromazina, agisce sull'ambiente di membrana, in particolare sulla membrana tiloidea in cui è incorporata l'alloficocianina. Alterando l'integrità della membrana, queste sostanze chimiche causano l'instabilità o la dissociazione della proteina. Questo è simile a ciò che fa il toluene, anche se con un meccanismo diverso. Il toluene influisce sulla composizione lipidica della membrana e di conseguenza sulla localizzazione e sulla stabilità dell'allofocianina nei ficobilisomi.

Denaturanti come il cloridrato di guanidina e l'urea agiscono dispiegando la proteina, compromettendone la funzionalità. In modo simile, il ditiotreitolo (DTT) riduce i legami disolfuro all'interno della proteina, causandone la dissociazione nelle sue singole subunità, rendendola di fatto inabile. Sostanze chimiche come la N-Etilmaleimide e la Formamide agiscono su gruppi chimici specifici all'interno dell'alloficocianina. Ad esempio, l'N-Etilmaleimide reagisce con i gruppi sulfidrilici, provocando modifiche che fanno perdere alla proteina la sua struttura e funzionalità. D'altra parte, la formammide denatura l'alloficocianina interrompendo i legami idrogeno che sono essenziali per la sua struttura. Detergenti come il sodio dodecil solfato solubilizzano la proteina, rimuovendola dal suo ambiente nativo e rendendola così non funzionale. L'etanolo agisce solubilizzando i bilayer lipidici, causando la dissociazione dell'allofocianina dai ficobilisomi, mentre il cloruro di sodio ad alte concentrazioni induce uno stress ionico, destabilizzando ulteriormente la proteina.