Gli inibitori che hanno come bersaglio la subunità grande del fattore di assemblaggio della cromatina ATP-dipendente (ACF) sono fondamentali per modulare il suo ruolo nell'assemblaggio dei nucleosomi e nel rimodellamento della cromatina. I composti che alterano la modificazione post-traslazionale degli istoni, come gli inibitori dell'istone deacetilasi, aumentano l'acetilazione degli istoni, determinando uno stato cromatinico più rilassato che riduce la capacità di ACF di interagire con la cromatina e di assemblare efficacemente i nucleosomi. Allo stesso modo, gli inibitori che influenzano i modelli di metilazione del DNA e le proprietà di legame al DNA, come gli inibitori della DNA metiltransferasi e della sequenza ricca di G-C, possono impedire il reclutamento e la successiva attività di ACF in specifici loci genomici. Questa alterazione del paesaggio cromatinico può portare a una diminuzione della domanda di servizi di assemblaggio della cromatina da parte di ACF.
Inoltre, la regolazione della funzione di ACF si estende all'influenza dei processi cellulari e alla disponibilità di fattori di modifica della cromatina correlati. Gli inibitori del proteasoma, gli agenti che alterano i microtubuli e gli inibitori delle chinasi che modulano l'attività dei fattori di trascrizione e la progressione del ciclo cellulare possono influenzare indirettamente la funzione di assemblaggio della cromatina di ACF. Questi inibitori possono portare a un accumulo di proteine poliubiquitinate e a cambiamenti nella dinamica cellulare, che possono a loro volta ridurre la necessità di rimodellare la cromatina da parte di ACF. Anche gli inibitori della RNA polimerasi II, delle proteine bromodominio e delle istone acetiltransferasi contribuiscono alla riduzione dell'attività funzionale di ACF, diminuendo la richiesta di assemblaggio dei nucleosomi in risposta ai cambiamenti trascrizionali e alterando i segni epigenetici che guidano il processo di rimodellamento della cromatina.
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