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T1-cadherin CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-401986-ACT | 20 µg | $397.00 |
CDH9は、カドヘリンスーパーファミリーに属するカルシウム依存性の細胞間接着分子であるT1-カドヘリンをコードしており、組織のパターン形成や細胞間接合の維持に寄与します。CDH9は、同種結合(ホモフィリック結合)や細胞骨格の組織化との連携を通じて、細胞極性、細胞移動、神経突起伸長といったプログラムに影響を与え、発生シグナル伝達や接触依存的な増殖制御と交差します。カドヘリンの発現プロファイルが変化すると、接着と運動性の状態バランスが移行し、局所的なシグナル環境も再構築され得るため、CDH9は細胞浸潤、分化、ネットワーク形成の基盤機構を研究するうえで有用な結節点となります。ヒトの生物学においては、接着や連結性が損なわれる状況—神経発達やがん関連の過程など—で、CDH9の発現異常が検討されてきました。
T1-cadherin CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性CDH9の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
T1-cadherin CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における CDH9 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はCDH9転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性T1-cadherinの発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のCDH9遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるT1-cadherin依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびCDH9発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるT1-cadherin経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。