Plasmide CRISPR/Cas9 KO Sox-8 (h): sc-406693

Présentation

SOX8 code le facteur de transcription Sox-8, membre de la famille SOX (SRY-related HMG-box), qui se lie à l’ADN via un domaine HMG afin de réguler la spécification des lignages et les programmes de différenciation. Sox-8 participe à des réseaux transcriptionnels qui contrôlent les dérivés de la crête neurale, le développement des cellules gliales et des oligodendrocytes, ainsi que certains aspects de la biologie gonadique et squelettique, grâce à des interactions dépendantes du contexte avec des cofacteurs et la chromatine. En modulant des programmes d’expression génique liés aux décisions de destinée cellulaire, à la prolifération et au remodelage de la matrice extracellulaire, SOX8 contribue aux voies du développement et à l’homéostasie tissulaire. Une expression dérégulée de SOX8 ou des altérations des circuits de la famille SOX ont été associées à des états transcriptionnels oncogéniques et à des anomalies du développement, ce qui étaye sa pertinence pour des études mécanistiques de la régulation génique impliquée dans les maladies.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO Sox-8 (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène SOX8 dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du SOX8, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert SOX8 à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine Sox-8.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en SOX8 pour l'étude de la signalisation de Sox-8, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de SOX8 essentiels à la fonction de Sox-8
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de SOX8 pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le Sox-8 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le Sox-8 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus SOX8. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le Sox-8 plasmide HDR (h) et le Sox-8 (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie SOX8 pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles SOX8 définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.