Not CRISPR data: the image illustrates antibody quality for visualizing CRISPR experiment results.
Not CRISPR data: the image illustrates antibody quality for visualizing CRISPR experiment results.
Rent3b CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-406904
- 対象生物種: human
- 20 µg のトランスフェクション準備済み、精製したプラスミドDNA、～20回トランスフェクション
- Rent3b CRISPR/Cas9 ノックアウト（KO）プラスミド（h）は、GeCKO v2ライブラリ由来の配列を用いて最大のノックアウト効率を実現するよう設計された、Cas9ヌクレアーゼおよび標的特異的な20塩基対のガイドRNA（gRNA）をそれぞれコードするプラスミドのプールです
- gRNA配列は、Cas9を誘導してRent3bゲノム座において部位特異的な二本鎖切断（DSBs）を引き起こし、非相同末端結合（NHEJ）を介して遺伝子ノックアウトをもたらします
- ピューロマイシン耐性遺伝子とRFP遺伝子はLoxP部位で挟まれているため、安定したノックアウト細胞株を樹立した後、Creリコンビナーゼ（Creベクター：sc-418923）を用いて選択マーカーを除去することができる。
- トランスフェクションの後、遺伝子ノックアウト効果は、抗体を用いたWB、IFまたはIHCによって検定されることができます: Rent3b 抗体 (D-1): sc-514564
注文情報
| 製品名 | カタログ # | 単位 | 価格 | 数量 | お気に入り | |
Rent3b CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h) | sc-406904 | 20 µg | $397.00 |
概要
UPF3Bは、ナンセンス変異依存的mRNA分解（NMD）機構の中核構成要素であるRent3bをコードしており、早期終止コドンを含むmRNAを除去するとともに、生理的転写産物の一部を制御することでトランスクリプトームの健全性を保っています。Rent3bはエクソン接合複合体（EJC）に連動した監視機構に関与し、UPF2やUPF1などのNMD因子と相互作用して、翻訳終結を標的RNAの分解へと結び付けます。これらの働きを通じて、UPF3BはRNAの品質管理、遺伝子発現の恒常性、ならびに異常mRNA処理に関連する細胞ストレス応答に影響を与えます。UPF3B依存的NMDの破綻は、神経発達に関わる表現型や、神経疾患をはじめとするRNA代謝関連疾患に関連した発現プログラムの変化と結び付けられています。
Rent3b CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるUPF3B遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、UPF3B内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。
このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、UPF3Bのオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、Rent3bタンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。
このCRISPRノックアウトシステムにより、Rent3bシグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、UPF3B欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。
主な特徴
- Rent3bの機能に不可欠なUPF3Bエクソンを標的とするsgRNA
導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
ノックアウト効率を向上させるための、UPF3Bゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
トランスフェクションによる導入に対応
設計バリエーション
CRISPRs +/- HDR
- Rent3b CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびRent3b CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、UPF3B遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
Rent3b HDRプラスミド（h）および Rent3b HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはUPF3Bホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のUPF3B標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。