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Pax-6 CRISPR Activationプラスミド (m) | sc-422119-ACT | 20 µg | $397.00 |
マウスPax6はPax-6転写因子をコードしており、ペアードボックス/ホメオボックスをもつDNA結合型の転写制御因子として、眼、前脳、膵内分泌系の発生に必要な遺伝子発現プログラムを統括します。Pax-6はWnt、Shh、BMP/TGF-β、Notchなどの発生シグナルネットワークと連携し、前駆細胞の規定、系譜へのコミットメント、神経分化を制御します。Pax6の発現量(ドサージ)や制御活性の変化は発生パターニングを乱し、モデル系において先天性の眼形成異常、神経発達障害、内分泌機能異常と関連づけられています。マスター制御因子として、Pax-6は細胞運命決定の基盤となるシス制御ロジック、クロマチン状態の遷移、転写回路を研究するために頻繁に用いられます。
Pax-6 CRISPR活性化プラスミド(m)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性Pax6の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
Pax-6 CRISPR 活性化プラスミド (m) は、ヒト細胞株における Pax6 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はPax6転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性Pax-6の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のPax6遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるPax-6依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびPax6発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるPax-6経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。