N-cadherin CRISPR Activationプラスミド (h): sc-400109-ACT
- 対象生物種: human
- 20 µg のトランスフェクション準備済み、精製したプラスミドDNA、～20回トランスフェクション
- N-cadherin CRISPR Activationプラスミド (h)は、特異的に遺伝子の発現量を増加させるため、相乗的活性化メディエーター(SAM)転写活性化システムです。
- N-cadherin CRISPR Activationプラスミド (h)は、1:1:1の質量比で以下の3つのプラスミドがら成る：トランス活性化ドメインVP64に溶解する非活性化されたCas9 (dCas9)ヌクレアーゼ(D10A と H840A)をコード化したのプラスミド（ブラストサイジン耐性遺伝子を含めて）、MS2-p65-HSF1融合蛋白質をコード化したのプラスミド（ハイグロマイシン耐性遺伝子を含めて）、2つのMS2 RNAアプタマーに溶解する目標特異的な20ntガイドRNAをコード化したのプラスミド（ピューロマイシン耐性遺伝子を含めて）。
- 得られたSAM複合体は、部位特異的な約200-250nt転写開始点の上流の領域に結合し、転写因子の強いリクルートメントを提供し、遺伝子の高い活性化効果が得られます。
- N-cadherin CRISPR活性化プラスミド（h）およびN-cadherin CRISPR活性化プラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、CDH2転写開始点の上流にある異なる調節領域を標的としています。いずれか一方、または両方のデザインが利用可能である可能性があります
- トランスフェクションの後、遺伝子ノックアウト効果は、抗体を用いたWB、IFまたはIHCによって検定されることができます: N-cadherin 抗体 (D-4): sc-8424
注文情報
| 製品名 | カタログ # | 単位 | 価格 | 数量 | お気に入り | |
N-cadherin CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-400109-ACT | 20 µg | $397.00 | |||
N-cadherin CRISPR Activationプラスミド (h2) | sc-400109-ACT-2 | 20 µg | $397.00 |
CDH2 は、カルシウム依存性の細胞間接着受容体である N-カドヘリンをコードしており、接着結合（adherens junction）において同種結合（ホモフィリック結合）を介して細胞同士を結び付け、発生や組織の再構築（リモデリング）の過程で組織構築を整えます。N-カドヘリンはカテニンおよびアクチン細胞骨格との連結を通じて、接触依存的シグナル伝達、細胞極性、細胞移動を制御し、上皮間葉転換（EMT）、メカノトランスダクション、増殖因子受容体間のクロストークに影響する経路とも交差します。CDH2 の発現変化は、細胞の浸潤性、シナプス結合性、間質との相互作用の変化と関連しており、がん進展、線維化、神経発生過程の研究において重要です。さらに、細胞表面の接着分子としての N-カドヘリンは、多様なヒト細胞モデルにおいて、間葉系様状態のマーカーや、動的な細胞間接着制御の指標としても用いられます。
N-cadherin CRISPR活性化プラスミド（h）は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性CDH2の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
N-cadherin CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における CDH2 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異（D10AおよびN863A）を有する、触媒活性のないCas9（dCas9）を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はCDH2転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性N-cadherinの発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のCDH2遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるN-cadherin依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびCDH2発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるN-cadherin経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。