hnRNP A/B CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m): sc-420896

概要

Hnrnpabは、マウスのヘテロ核リボヌクレオタンパク質A/B（hnRNP A/B）をコードしており、転写直後の新生転写産物に結合して、pre-mRNAスプライシング、選択的エクソン選択、mRNAの安定性、核―細胞質間輸送を制御するRNA結合タンパク質である。hnRNP A/Bはリボヌクレオタンパク質複合体内で転写共役および転写後の遺伝子制御に関与し、細胞増殖や分化の過程におけるトランスクリプトーム動態の協調に寄与する。RNAプロセシングおよび転写後制御における役割を通じて、hnRNP A/B機能の攪乱は、ストレス応答、ゲノム維持、プロテオスタシスに関連する経路に影響を及ぼし得る。hnRNPファミリーの活性異常は、がんや神経変性におけるRNA代謝の変化と関連づけられており、Hnrnpabは疾患関連モデルでの機序解明研究に有用な標的となる。

hnRNP A/B CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）は、mouse細胞株におけるHnrnpab遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、Hnrnpab内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、Hnrnpabのオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、hnRNP A/Bタンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、hnRNP A/Bシグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、Hnrnpab欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• hnRNP A/Bの機能に不可欠なHnrnpabエクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、Hnrnpabゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• hnRNP A/B CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）およびhnRNP A/B CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m2）によってコードされるgRNAは、Hnrnpab遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  hnRNP A/B HDRプラスミド（m）および hnRNP A/B HDRプラスミド（m2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはHnrnpabホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のHnrnpab標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。