GalNAc-T13 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-407103

概要

GALNT13 は、ポリペプチド N-アセチルガラクトサミニルトランスフェラーゼ 13（GalNAc-T13）をコードしています。GalNAc-T13 はゴルジ体に局在するムチン型 O-グリコシル化の開始酵素で、新生の分泌タンパク質および膜タンパク質のセリン／スレオニン残基に GalNAc を転移します。受容体、接着分子、ムチン上の O-グリカンパターンを形成することで、GalNAc-T13 はタンパク質の安定性、トラフィッキング、リガンド相互作用に影響を及ぼし、それらを介してシグナル伝達や細胞間コミュニケーションの過程に作用し得ます。GALNT13 発現の変化は複数の腫瘍コンテキストで報告されており、浸潤性や転移能といった悪性細胞の挙動の変化と関連しています。これは、O-グリコシル化が細胞外インターフェースの再構築に関与するという見方と整合的です。そのため本遺伝子は、ヒト細胞における糖タンパク質生合成、分泌経路機能、ならびに糖鎖制御を受けるシグナル伝達ネットワークの研究に関連します。

GalNAc-T13 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるGALNT13遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、GALNT13内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、GALNT13のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、GalNAc-T13タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、GalNAc-T13シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、GALNT13欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• GalNAc-T13の機能に不可欠なGALNT13エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、GALNT13ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• GalNAc-T13 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびGalNAc-T13 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、GALNT13遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  GalNAc-T13 HDRプラスミド（h）および GalNAc-T13 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはGALNT13ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のGALNT13標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。