Barx1 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (m): sc-419290

Descripción general

Barx1 (BARX homeobox 1) es un factor de transcripción homeobox que ayuda a regular el patrón embrionario y la organogénesis en el ratón, con funciones destacadas en el desarrollo craneofacial y en tejidos derivados del intestino anterior. Al unirse al ADN mediante su homeodominio, Barx1 influye en programas de transcripción que coordinan las interacciones epitelio-mesenquimatosas, la especificación del destino celular y la remodelación de la matriz extracelular durante la morfogénesis. La actividad de Barx1 se interseca con redes de señalización del desarrollo, como las vías Wnt/β-catenina y BMP, donde puede moldear los resultados de diferenciación y la formación de límites tisulares. La desregulación de las redes génicas asociadas a Barx1 es relevante para estudios de malformaciones congénitas y trastornos del desarrollo que afectan estructuras faciales y gastrointestinales.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO Barx1 (m) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen Barx1 en líneas celulares mouse. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del Barx1 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de Barx1 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína Barx1.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en Barx1 para la investigación de la señalización de Barx1, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de Barx1 críticos para la función de Barx1
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de Barx1 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido Barx1 CRISPR/Cas9 KO (m) y el plásmido Barx1 CRISPR/Cas9 KO (m2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus Barx1. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR Barx1 (m) y el plásmido HDR Barx1 (m2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología Barx1 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana Barx1 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.