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AFP/Alpha fetoprotein CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-400355-ACT | 20 µg | $397.00 |
AFPは、胎児肝臓および卵黄嚢で主に産生され、出生後に発現が低下する主要な腫瘍胎児性(oncofetal)の分泌性糖タンパク質であるα-フェトプロテインをコードします。AFPは、肝芽細胞の分化を支援し、増殖や生存に影響する細胞外シグナルの手掛かりを調節することで、発生プログラムに寄与します。成体組織では、AFPの異常な再発現は、肝がんや関連する肝疾患で観察される、肝細胞系譜の脱分化や転写状態の変化と関連しています。分泌性でバイオマーカー様のタンパク質として、AFPは肝発生、肝細胞状態の遷移、腫瘍関連の分泌表現型を研究する際に頻繁に用いられます。
AFP/Alpha fetoprotein CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性AFPの発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
AFP/Alpha fetoprotein CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における AFP 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はAFP転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性AFP/Alpha fetoproteinの発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のAFP遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるAFP/Alpha fetoprotein依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびAFP発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるAFP/Alpha fetoprotein経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。