XRN1 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-401910

Panoramica

XRN1 codifica un’esoribonucleasi 5′→3′ altamente conservata che guida il turnover dell’mRNA citoplasmatico degradando i trascritti decappati e rimuovendo gli intermedi della degradazione dell’RNA. È una componente centrale della regolazione genica post-trascrizionale, collegando la decappatura e la degradazione esonucleolitica a vie che controllano la sorveglianza dell’mRNA, la dinamica dei granuli da stress e il riconoscimento innato di RNA aberranti o virali. Attraverso il suo ruolo nel controllo di qualità dell’RNA e nel rimodellamento del trascrittoma, XRN1 influenza le risposte cellulari allo stress e all’infezione, oltre a programmi più ampi di proliferazione e differenziamento. Un’alterata degradazione dell’RNA e una compromissione dell’attività di XRN1 sono state associate a cambiamenti nella segnalazione dell’interferone, a fenotipi del neurosviluppo e a variazioni delle reti di espressione genica rilevanti per il cancro.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO XRN1 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene XRN1 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del XRN1 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto XRN1 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina XRN1.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di XRN1 per lo studio della segnalazione di XRN1, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni XRN1 critici per la funzione di XRN1
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di XRN1 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal XRN1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal XRN1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus XRN1. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal XRN1 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR XRN1 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia XRN1 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio XRN1 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.