USF-1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m): sc-423628

概要

上流転写因子1（USF-1）は、マウスのUsf1遺伝子にコードされる塩基性ヘリックス・ループ・ヘリックス（bHLH）ロイシンジッパー型転写因子であり、E-boxモチーフに結合して、代謝、成長、ストレス応答を制御する遺伝子発現プログラムを協調的に調節します。USF-1はシグナル入力を統合し、共役因子やクロマチン修飾複合体との相互作用を介して、脂質・グルコース恒常性、ミトコンドリア機能、細胞周期進行に関与する転写ネットワークを制御します。マウス系では、Usf1活性の変化が、心代謝形質や肝臓の遺伝子制御の研究に関連する、代謝表現型の破綻や炎症性シグナルの異常と関連づけられています。幅広く発現する転写調節因子として、USF-1は転写制御、エンハンサー—プロモーター間コミュニケーション、ならびに複雑疾患感受性の基盤となる経路間クロストークにおける役割の観点から、しばしば解析対象となります。

USF-1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）は、mouse細胞株におけるUsf1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、Usf1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、Usf1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、USF-1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、USF-1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、Usf1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• USF-1の機能に不可欠なUsf1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、Usf1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• USF-1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）およびUSF-1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m2）によってコードされるgRNAは、Usf1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  USF-1 HDRプラスミド（m）および USF-1 HDRプラスミド（m2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはUsf1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のUsf1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。