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U1 SnRNP 70 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-401829-ACT | 20 µg | $397.00 |
SNRNP70は、pre-mRNAスプライシングの過程で5′スプライス部位を認識し、スプライソソームの組み立てを開始するU1小核リボヌクレオタンパク質(U1 snRNP)の中核構成因子であるU1 snRNP 70をコードします。U1 snRNAや他のスプライソソーム因子との相互作用を介して、U1 snRNP 70は正確なエクソン定義、転写と共役したRNAプロセシング、ならびに遺伝子発現プログラムの全体的な制御を支えます。スプライソソーム機能の破綻やスプライス部位選択の変化は、細胞ストレス応答やがん性の転写リプログラミングで繰り返し見られる特徴であり、SNRNP70はRNAプロセシング制御を研究するうえで有用な結節点となります。スプライソソームの攪乱に関連する異常スプライシングパターンは、RNA代謝が損なわれる神経変性やその他の疾患とも関係しているため、U1関連経路の機構解明研究が動機づけられています。
U1 SnRNP 70 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性SNRNP70の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
U1 SnRNP 70 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における SNRNP70 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はSNRNP70転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性U1 SnRNP 70の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のSNRNP70遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるU1 SnRNP 70依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびSNRNP70発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるU1 SnRNP 70経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。