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TFIIIB'' CRISPR Activationプラスミド (m) | sc-436781-ACT | 20 µg | $397.00 |
マウスBdp1は、RNAポリメラーゼIII(Pol III)の一般転写因子TFIIIBの中核サブユニット(TFIIIB'')をコードしており、TBPおよびBRFタンパク質と協調してPol IIIプロモーター上に前開始複合体を組み立てます。この働きを通じてTFIIIB''は、tRNAなどの小型非コードRNAやその他のPol III依存性転写産物の転写を支え、Bdp1の機能をタンパク質合成能、細胞増殖、ストレス適応プログラムと結び付けます。Pol III転写の制御は、栄養やマイトジェンに応答するシグナル伝達経路と密接に連動しており、増殖制御の破綻を伴う状況ではしばしば変化がみられます。Pol IIIの産生量は翻訳恒常性や代謝適応に影響するため、Bdp1を攪乱することは、疾患関連状態で不均衡になり得る転写供給系を研究するための取り組みやすい足掛かりとなります。
TFIIIB″ CRISPR活性化プラスミド(m)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性Bdp1の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
TFIIIB″ CRISPR 活性化プラスミド (m) は、ヒト細胞株における Bdp1 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はBdp1転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性TFIIIB″の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のBdp1遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるTFIIIB″依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびBdp1発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるTFIIIB″経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。