SYND3/SDC3/Syndecan-3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m): sc-423236

概要

Sdc3は、細胞表面で細胞外マトリックス（ECM）からのシグナルや成長因子の濃度勾配を組織化する、膜貫通型ヘパラン硫酸プロテオグリカンであるシンデカン3（SYND3/SDC3）をコードします。SDC3はヘパラン硫酸依存性リガンドに結合することで、受容体チロシンキナーゼおよびケモカインのシグナル伝達を調節し、細胞骨格の再編成、細胞移動、神経突起伸長、シナプス可塑性に影響を与えます。マウスではSdc3は神経系および代謝関連組織での発現が顕著で、軸索誘導、細胞―マトリックス接着、炎症性シグナル伝達を制御する経路に関与します。シンデカン3機能の破綻は、神経発達および神経炎症プロセス、ならびにエネルギーバランス表現型の変化と関連づけられており、中枢神経系（CNS）と代謝研究における機構解明の要所（メカニスティック・ノード）としての有用性が示唆されています。

SYND3/SDC3/Syndecan-3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）は、mouse細胞株におけるSdc3遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、Sdc3内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、Sdc3のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、SYND3/SDC3/Syndecan-3タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、SYND3/SDC3/Syndecan-3シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、Sdc3欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• SYND3/SDC3/Syndecan-3の機能に不可欠なSdc3エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、Sdc3ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• SYND3/SDC3/Syndecan-3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）およびSYND3/SDC3/Syndecan-3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m2）によってコードされるgRNAは、Sdc3遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  SYND3/SDC3/Syndecan-3 HDRプラスミド（m）および SYND3/SDC3/Syndecan-3 HDRプラスミド（m2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはSdc3ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のSdc3標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。