SRm300 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-403447

概要

SRRM2は、核内スペックルに局在し、スプライソソームの組み立ておよびpre-mRNAのプロセシングを支える、大型のセリン／アルギニン（SR）リッチなスプライシング補因子SRm300をコードします。SRm300は選択的スプライシングの決定に寄与し、転写とスプライシングの共役を調整することで、RNA成熟、mRNAの核外輸送能、ならびにプロテオーム多様性に影響します。これらの役割を通じてSRRM2は、細胞周期制御、DNA損傷応答、ストレス適応的な遺伝子発現プログラムに関連する経路にも作用します。SRRM2依存的なスプライシングネットワークの破綻は、がんや神経発達・神経変性疾患の文脈で観察される異常なアイソフォーム利用と関連づけられており、RNAプロセシングの機構研究において重要です。

SRm300 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるSRRM2遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、SRRM2内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、SRRM2のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、SRm300タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、SRm300シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、SRRM2欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• SRm300の機能に不可欠なSRRM2エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、SRRM2ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• SRm300 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびSRm300 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、SRRM2遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  SRm300 HDRプラスミド（h）および SRm300 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはSRRM2ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のSRRM2標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。