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PRDM11 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-417861-ACT | 20 µg | $397.00 |
PRDM11は、PR/SETドメインを含むジンクフィンガータンパク質をコードしており、クロマチンに関連した転写制御および系譜特異的な遺伝子発現プログラムに関与すると考えられています。PRDMファミリーの一員として、PRDM11は、分化や細胞アイデンティティの維持を含む細胞状態の移行を協調させるエピジェネティック制御機構と関連しています。PRDMファミリーの転写制御因子の制御異常は、がんやその他の疾患における発生経路の変化や異常な遺伝子発現ネットワークと関連づけられており、PRDM11依存的な転写回路の解明が求められています。PRDM11の機能を研究することは、クロマチンリモデリング、転写因子のリクルート、ならびに下流標的遺伝子の文脈依存的制御に関する機序研究を支えるものです。
PRDM11 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性PRDM11の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
PRDM11 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における PRDM11 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はPRDM11転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性PRDM11の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のPRDM11遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるPRDM11依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびPRDM11発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるPRDM11経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。