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NIPBL CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-403371-ACT | 20 µg | $397.00 |
NIPBLは、姉妹染色分体のコヒーシン依存的な結合(コヒージョン)の確立と維持、および高次ゲノム構造の形成に必須な、コヒーシン装填因子をコードしている。クロマチン上でのコヒーシン動態を制御することにより、NIPBLはDNA複製、DNA損傷応答、ならびに系譜特異的な転写プログラムを形作る長距離エンハンサー–プロモーター間コミュニケーションに影響を与える。NIPBL機能の破綻は発生関連遺伝子の発現制御異常と強く結び付いており、コーネリア・デ・ランゲ症候群の主要な遺伝学的原因でもあることから、転写制御機構を研究するうえで重要な結節点となっている。さらに、クロマチンアーキテクチャにおける役割を通じて、NIPBLはヒト細胞における細胞周期進行およびゲノム安定性を司る経路とも関連している。
NIPBL CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性NIPBLの発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
NIPBL CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における NIPBL 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はNIPBL転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性NIPBLの発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のNIPBL遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるNIPBL依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびNIPBL発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるNIPBL経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。