IRX1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m): sc-421153

概要

Irx1 は、Iroquois ホメオボックス型転写因子 IRX1 をコードしており、核内で DNA に結合して転写を制御する因子として、胚組織のパターニングや系譜特異化の誘導に関与します。マウスの発生過程では、IRX1 は形態形成、細胞運命決定、器官原基の空間的配置を司る転写プログラムに寄与し、より広範なホメオボックス依存的な制御ネットワークと統合的に機能します。IRX1 の発現異常や制御機構の破綻は発生異常と関連づけられており、がん生物学に関わる異常分化状態の文脈でも研究されています。転写制御の結節点として、IRX1 は下流標的遺伝子、クロマチン状態への依存性、ならびに組織アイデンティティを規定するシグナル伝達経路とのクロストークの観点から、しばしば解析対象となります。

IRX1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）は、mouse細胞株におけるIrx1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、Irx1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、Irx1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、IRX1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、IRX1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、Irx1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• IRX1の機能に不可欠なIrx1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、Irx1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• IRX1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）およびIRX1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m2）によってコードされるgRNAは、Irx1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  IRX1 HDRプラスミド（m）および IRX1 HDRプラスミド（m2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはIrx1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のIrx1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。