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HoxA11 CRISPR Activationプラスミド (h2) | sc-405264-ACT-2 | 20 µg | $397.00 |
ヒトのHOXA11は、ホメオボックス型転写因子HoxA11をコードしており、DNA結合性の制御因子として胚発生における前後軸パターニングと領域特異的アイデンティティの確立を助けるとともに、間葉系および生殖管系譜における分化プログラムにも寄与する。HoxA11はホメオボックスモチーフの認識と補因子依存的な転写制御を介して遺伝子発現を調節し、形態形成、組織リモデリング、細胞運命決定を司る発生シグナルネットワークと連携する。HOXA11の発現異常やエピジェネティックな変化は、異常なHOX遺伝子プログラムが分化・増殖状態の変容を支える先天奇形やがんと関連づけられている。HOXA11を標的とした遺伝子編集や機能ゲノミクス解析は、シス制御エレメントの同定、下流の転写回路の定義、ならびにヒト細胞モデルにおける発生・疾患関連表現型の検証に用いられている。
HoxA11 CRISPR活性化プラスミド(h2)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性HOXA11の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
HoxA11 CRISPR 活性化プラスミド (h2) は、ヒト細胞株における HOXA11 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はHOXA11転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性HoxA11の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のHOXA11遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるHoxA11依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびHOXA11発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるHoxA11経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。