hnRNP E1 Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO (m): sc-423930

Visão geral

Pcbp1 codifica a ribonucleoproteína nuclear heterogênea E1 (hnRNP E1) de camundongo, uma proteína ligadora de RNA que reconhece elementos ricos em citosina (C) para controlar a estabilidade e a tradução de mRNAs. A hnRNP E1 participa da regulação gênica pós-transcricional ligada à progressão do ciclo celular, às respostas ao estresse e à diferenciação, ao modular a disponibilidade de transcritos no citoplasma e sua tradução nos ribossomos. Por meio de suas funções no processamento de RNA e no controle translacional, a hnRNP E1 influencia vias associadas à transição epitélio–mesenquimal, à remodelação do citoesqueleto e a programas de expressão gênica dependentes de sinalização. A atividade desregulada de PCBP1/hnRNP E1 tem sido associada à alteração da homeostase de RNA e a fenótipos relevantes para a biologia tumoral e para a sinalização inflamatória em modelos experimentais.

O Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO hnRNP E1 (m) é um conjunto de plasmídeos concebido para a interrupção direcionada do gene Pcbp1 em linhas celulares mouse. Cada plasmídeo coexpressa um RNA guia único (sgRNA) direcionado a um local distinto dentro do Pcbp1, juntamente com a nuclease Cas9 de Streptococcus pyogenes. Os plasmídeos também codificam GFP, permitindo a identificação fluorescente e o enriquecimento de células transfectadas com sucesso por microscopia de fluorescência ou citometria de fluxo.

O design multiguia aumenta a probabilidade de gerar inserções ou deleções (indels) que interrompem o quadro de leitura aberto do Pcbp1 na sequência da formação de quebras de cadeia dupla mediadas por Cas9. As quebras de ADN introduzidas pelo sistema CRISPR/Cas9 são reparadas através de vias endógenas de junção de extremidades não homólogas (NHEJ), resultando frequentemente em mutações de deslocamento de quadro que abolir a expressão da proteína hnRNP E1.

Este sistema de knockout CRISPR permite a geração eficiente de modelos celulares com deficiência de Pcbp1 para a investigação da sinalização de hnRNP E1, estudos de genómica funcional, investigação em biologia do cancro e avaliação de respostas terapêuticas em linhas celulares humanas.

Características principais

• sgRNAs direcionados para o(s) exão(ões) Pcbp1 críticos para a função hnRNP E1
  Coexpressão de SpCas9 e sgRNA a partir de um único plasmídeo para simplificar a administração
  Repórter GFP para identificação de células transfectadas
  Conjunto de plasmídeos direcionados para múltiplos locais genómicos Pcbp1 para melhorar a eficiência do knockout
  Compatível com administração por transfecção

Variantes de Design

CRISPRs +/- HDRs

• Os gRNAs codificados pelo hnRNP E1 Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO (m) e pelo hnRNP E1 Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO (m2) têm como alvo locais distintos dentro do locus Pcbp1. Pode estar disponível um ou ambos os designs de alvo. Consulte Produtos Relacionados para verificar a disponibilidade.
  As construções doadoras HDR codificadas pelo hnRNP E1 Plasmídeo HDR (m) e o Plasmídeo HDR hnRNP E1 (m2) contêm uma cassete de resistência à puromicina e um repórter RFP flanqueado por braços de homologia Pcbp1 para suportar a reparação dirigida por homologia em locais-alvo Pcbp1 definidos, correspondentes aos desenhos de KO CRISPR/Cas9. A disponibilidade do doador HDR pode variar. Consulte Produtos Relacionados para verificar a disponibilidade.

Apenas para uso em investigação. Não se destina a uso diagnóstico ou terapêutico.