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HMGI-C CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-401573-ACT | 20 µg | $397.00 |
HMGA2は、非ヒストンHMGタンパク質であるHMGI-C(建築型クロマチンタンパク質)をコードしており、ATリッチなDNAに結合してヌクレオソームの配置(組織化)や、増殖・分化・幹細胞様状態を制御する転写プログラムを調節します。クロマチンリモデリングのネットワークに関与し、TGF-β/SMADシグナル伝達やLIN28/let-7による転写後制御などの経路と協調して、上皮間葉転換(EMT)、細胞周期の進行、発生タイミングに影響を与えます。HMGA2の発現制御の破綻(異常発現)は、多様な腫瘍環境における転写ランドスケープの変化と関連し、間葉系腫瘍で繰り返し観察される特徴でもあることから、がん化(腫瘍化)および組織リモデリングに広く関与することが示唆されます。広範なゲノム領域に影響を及ぼす核内制御因子として、HMGA2はゲノム構造の形成、系譜決定、転写因子間の協調作用における役割の解明のために、頻繁に研究されています。
HMGI-C CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性HMGA2の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
HMGI-C CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における HMGA2 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はHMGA2転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性HMGI-Cの発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のHMGA2遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるHMGI-C依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびHMGA2発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるHMGI-C経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。