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HMG-1/HMGB1 CRISPR Activationプラスミド (m) | sc-420871-ACT | 20 µg | $397.00 | |||
HMG-1/HMGB1 CRISPR Activationプラスミド (m2) | sc-420871-ACT-2 | 20 µg | $397.00 |
Hmgb1はHMG-1/HMGB1をコードしており、これはDNAに結合して湾曲させ、ヌクレオソーム動態、転写、複製、DNA修復を調節する豊富な非ヒストン性クロマチンタンパク質です。核内では、HMGB1はDNA損傷応答に関与することでゲノム安定性を支えるとともに、細胞運命の決定に結びつく遺伝子発現プログラムにも影響を与えます。一方、細胞外へ放出されると、HMGB1は損傷関連分子パターン(DAMP)として機能し、TLRやRAGEが関与する受容体介在性応答を含む自然免疫シグナルや炎症経路を調節します。HMGB1活性の異常は、無菌性炎症、自己免疫、神経炎症、敗血症の生物学モデル、ならびにマウス系における腫瘍関連炎症などの文脈で広く研究されています。
HMG-1/HMGB1 CRISPR活性化プラスミド(m)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性Hmgb1の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
HMG-1/HMGB1 CRISPR 活性化プラスミド (m) は、ヒト細胞株における Hmgb1 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はHmgb1転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性HMG-1/HMGB1の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のHmgb1遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるHMG-1/HMGB1依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびHmgb1発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるHMG-1/HMGB1経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。