Histone cluster 1 H1E CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-402775

概要

HIST1H1Eは、ヒストンクラスター1 H1E（histone cluster 1 H1E）をコードしており、複製依存性のリンカーヒストンH1バリアントとしてヌクレオソームDNAに結合し、高次クロマチン構造を安定化してゲノムの凝縮に影響を与えます。クロマチンのアクセス性を調節することで、H1Eはクロマチンリモデリングや修復因子のリクルートに作用し、転写プログラム、DNA複製タイミング、DNA損傷応答の制御に寄与します。H1ファミリーの量比（ストイキオメトリー）の変化やリンカーヒストンのダイナミクスの異常は、がんや神経発達障害で見られるエピジェネティックな制御異常と関連づけられており、HIST1H1Eに関わる攪乱は細胞運命決定やゲノム安定性に影響し得ます。さらに、ヒストンクラスター1座の一部として、HIST1H1EはS期に連動したヒストン発現やクロマチンアセンブリーの研究においても重要です。

Histone cluster 1 H1E CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるHIST1H1E遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、HIST1H1E内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、HIST1H1Eのオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、Histone cluster 1 H1Eタンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、Histone cluster 1 H1Eシグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、HIST1H1E欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• Histone cluster 1 H1Eの機能に不可欠なHIST1H1Eエクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、HIST1H1Eゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• Histone cluster 1 H1E CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびHistone cluster 1 H1E CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、HIST1H1E遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  Histone cluster 1 H1E HDRプラスミド（h）および Histone cluster 1 H1E HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはHIST1H1Eホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のHIST1H1E標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。