DPF2 Double Nickase Plasmid (h): sc-404801-NIC
- Zielspezies: human
- 20 µg transfektionsfertige, aufgereinigte Plasmid DNA; geeignet für 20 Transfektionen
- Das DPF2 Double Nickase Plasmid (h) wird als Plasmid-Paar geliefert. Die einzelnen Plasmide kodieren für eine D10A mutierte Cas9 Nuklease sowie für je eine unterschiedliche, zielspezifische 20nt guide RNA (gRNA) Sequenz. Dies erlaubt eine hohe Knockout-Effizienz bei gleichzeitig größerer Spezifität als das entsprechende CRISPR/Cas9 KO Plasmid
- gRNA Sequenzpaare liegen ca. 20 bp auseinander um ein spezifisches Cas9-vermitteltes "Double Nicking" der genomischen DNA zu erlauben und so im Resultat den Effekt eines Doppelstrangbruchs nachzuahmen.
- Ein Plasmid kodiert für ein Puromycin-Resistenzgen zur Selektion von stabilen Knockout-Zellen. Das andere Plasmid kodiert für ein GFP-Gen für den visuellen Nachweis der Transfektion
- DPF2 Double-Nickase-Plasmid (h) und DPF2 Double-Nickase-Plasmid (h2) kodieren unterschiedliche gepaarte gRNA-Designs, die auf DPF2 abzielen. Möglicherweise ist eines oder sind beide Designs verfügbar
- Nach der Transfektion kann die Effizienz des Gen-Knockouts per Western Blot oder histologisch mit folgendem Antikörper überprüft werden: DPF2: sc-514297
Bestellinformation
| Produkt | Katalog # | EINHEIT | Preis | ANZAHL | Favoriten | |
DPF2 Double Nickase Plasmid (h) | sc-404801-NIC | 20 µg | $410.00 | |||
DPF2 Double Nickase Plasmid (h2) | sc-404801-NIC-2 | 20 µg | $410.00 |
DPF2 (double PHD fingers 2; auch als BAF45d bekannt) ist ein chromatinassoziierter Adapter, der Histonmarkierungen über seine PHD-Zinkfinger erkennt und dabei hilft, SWI/SNF-(BAF-)Chromatin-Remodeling-Komplexe an spezifische genomische Loci zu rekrutieren. Durch die Kopplung epigenetischer Signale an die Umpositionierung von Nukleosomen trägt DPF2 zu Transkriptionsregulationsprogrammen bei, die die Zellzykluskontrolle, Differenzierung und stimulusabhängige Genexpression prägen. DPF2-abhängiges Chromatin-Remodeling überschneidet sich mit Signalwegen, die entwicklungsbezogene Gennetzwerke und DNA-schadensassoziierte transkriptionelle Antworten steuern. Eine Fehlregulation von SWI/SNF-Komponenten und Chromatin-Reader-Funktionen, einschließlich DPF2-assoziierter Aktivitäten, wird häufig im Zusammenhang mit veränderten Transkriptionszuständen untersucht, wie sie bei Krebs und anderen Erkrankungen mit epigenetischen Störungen beobachtet werden.
DPF2 Das Double-Nickase-Plasmid (h) besteht aus einem aufeinander abgestimmten Plasmidpaar, das für die hochspezifische Bearbeitung des DPF2-Lokus in human-Zelllinien entwickelt wurde. Jedes Plasmid exprimiert eine Cas9-D10A-Nickase und eine spezifische sgRNA, die auf entgegengesetzte DNA-Stränge innerhalb von DPF2 abzielt. Wenn sie auf benachbarte Stellen auf entgegengesetzten DNA-Strängen gerichtet sind, erzeugen die beiden Nickasen versetzte Einzelstrang-Schnitte, die zusammen einen versetzten Doppelstrangbruch erzeugen, was eine koordinierte On-Target-Aktivität beider Guides erfordert. Der resultierende DNA-Bruch wird durch endogene zelluläre Reparaturwege behoben, meist durch nicht-homologe Endverknüpfung (NHEJ), was zu Insertionen oder Deletionen führt, die die DPF2-Funktion stören. Durch die Notwendigkeit einer doppelten sgRNA-Bindung am Zielort erhöht der Doppel-Nick-Ansatz die Spezifität der Bearbeitung und bietet eine komplementäre CRISPR-Strategie für Anwendungen, bei denen eine zusätzliche Kontrolle über die Zielgenauigkeit gewünscht ist.
Um eine effiziente Identifizierung editierter Zellen zu unterstützen, kodiert ein Plasmid GFP zur fluoreszierenden Visualisierung transfizierter Populationen, während das Begleitplasmid ein Puromycin-Resistenzgen für die Antibiotika-Selektion trägt. Zusammen unterstützen diese Merkmale eine effiziente Anreicherung co-transfizierter Populationen und vereinfachen die Validierung von Klonen mit DPF2-Störung.
Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.