DPF2 Double Nickaseプラスミド (h): sc-404801-NIC

DPF2（double PHD fingers 2、別名BAF45d）はクロマチン関連アダプターであり、PHD型亜鉛フィンガーを介してヒストン修飾マークを認識し、SWI/SNF（BAF）クロマチンリモデリング複合体を特定のゲノム座位へ誘導するのに寄与します。エピジェネティックなシグナルとヌクレオソーム再配置を結び付けることで、DPF2は細胞周期制御、分化、刺激応答性の遺伝子発現を形作る転写制御プログラムに関与します。DPF2依存的なクロマチンリモデリングは、発生過程の遺伝子ネットワークやDNA損傷に関連する転写応答を司る経路とも交差します。SWI/SNF構成要素の機能不全や、DPF2に関連する活動を含むクロマチンリーダー機能の破綻は、がんやその他のエピジェネティックな異常を伴う疾患で観察される転写状態の変化との関連で、しばしば研究対象となっています。

DPF2 ダブルニカースプラスミド（h）は、human 細胞株における DPF2 座の高特異性編集のために設計された、対となる2つのプラスミドから構成される。各プラスミドは、Cas9 D10Aニカースと、DPF2内の対向するDNA鎖を標的とする異なるsgRNAを発現する。対向するDNA鎖上の隣接する部位に誘導されると、2つのニカースはオフセットした一本鎖切断を生成し、これらが組み合わさってずれた二本鎖切断を生じさせる。これにより、両方のガイドによる協調的なオンターゲット活性が必要となる。生じたDNA切断は、細胞内の内在性修復経路、特に非相同末端結合（NHEJ）によって修復され、その結果、DPF2の機能を阻害する挿入または欠失が生じる。標的座標における2つのsgRNAの結合を必要とするこの二重ニッキング法は、編集の特異性を高め、標的精度に対するさらなる制御が求められる用途において、CRISPR戦略を補完するものである。

編集された細胞を効率的に同定するために、1つのプラスミドはトランスフェクトされた細胞集団を蛍光可視化するためのGFPをコードし、もう1つのプラスミドは抗生物質選別用のプロマイシン耐性遺伝子を保有しています。これらの機能により、共トランスフェクトされた細胞集団の効率的な濃縮が可能となり、DPF2が破壊されたクローンの検証が簡素化されます。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。